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Wofür steht der Genname „lexA“?

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Es ist ein wichtiges Gen, das in E coli das die SOS-Antwort und auch die Expression von Lambda-lytischen Phasengenen unterdrückt. UV-Licht und DNA-Schäden sind für ihren Abbau und damit die Expression von Reparaturgenen und, falls vorhanden, Lambda-Phagen-Genen verantwortlich. Ich konnte jedoch keine Referenz für den ursprünglichen Namen finden.


Ich würde mich für Lambda Excision A entscheiden. Begriffe wie lex oder rec stehen oft für das, was man als Gedächtnisstütze bezeichnen würde, wobei zum Beispiel rec kann für Rekombination stehen, oder umu für UV-Mutator. Die Namenskonventionen können schwierig sein.

Bearbeiten: Eine Studie von Roger Brent und Mark Ptashne aus dem Jahr 1981 stellt einige Daten aus ersten Studien fest, die zeigten, dass der lexA-Repressor eine Reihe von Genen einschließlich himA herunterreguliert, die ihrer Meinung nach für die Integration von Lambda-Phagen erforderlich sind.

http://www.pnas.org/content/78/7/4204.full.pdf


Laut dieser Website ist es eine Gedächtnisstütze für "Lambda-Exzision". Diese Verwendung habe ich auch in der wissenschaftlichen Literatur gefunden (zB Harami et al., 2013). Keine dieser Quellen verweist jedoch auf irgendetwas und ich kann kein definierendes Papier finden. Fast alle Papiere bezeichnen es einfach als lexA.

Soweit ich finden kann (es ist schwierig, diese alten Papiere auszugraben), wurde der Locus (nicht unbedingt das Gen) ursprünglich so beschrieben (Howard-Flanders und Boyce, 1966):

Es gibt einen … Ort, lex (Ort für Röntgenempfindlichkeit), in E coli Die K-12… [A]-Mutation an diesem Locus erhöht das Ausmaß des UV-induzierten DNA-Abbaus. Dieser Effekt ist ähnlich, aber weniger extrem als der des rec Ort…

Es ist möglich, dass, da dieser Locus besser charakterisiert wurde, der Name lex aus Gründen der Konsistenz mit der früheren Literatur beibehalten, aber neu definiert wurde, um ein besseres Verständnis seiner Funktion widerzuspiegeln (obwohl ich nicht glaube, dass "Lambda-Exzision" dies überhaupt sehr gut macht).


Verweise

Harami GM, Gyimesi M, Kovacs M. 2013. Von Schlüsseln zu Bulldozern: expandierende Rollen für geflügelte Helixdomänen in Nukleinsäure-bindenden Proteinen. Trends Biochem Sci 38(7):364-371

Howard-Flanders P, Boyce RP. 1966. DNA-Reparatur und genetische Rekombination: Studien an Mutanten von Escherichia coli Fehler in diesen Prozessen. Radiat Res Supp 6:156-184


Dies ist gut dokumentiert in Fortschritte in der mikrobiellen Physiologie, Band 16, Moseley und Williams, Seiten 116-117 (durchsuchbar über Google Books).

Mattern et al. (1966) bezeichneten Mutationen, die E coli Bs-1 empfindlich gegenüber Röntgenstrahlung als exr (Röntgenempfindlichkeit) Mutationen. Im selben Jahr bezeichneten Howard-Flanders und Boyce (1966) unabhängig voneinander äquivalente Mutationen in E coli K-12 wie lex (Locus für Röntgenempfindlichkeit). In beiden Stämmen lagen diese Mutationen in der Nähe der malB Ort (b4039; lexA ist b4043). Ein Jahr später verwendete Greenberg eine breitere Bezeichnung mit derselben kausalen Wurzel (Loci for Radiation Sensitivity), um dieselben Mutationen zu bezeichnen.

LexA ist auch bekannt als umuA (UV-Induktion von Mutationen) und tsl (thermosensitive Mutationen).


Schau das Video: Lexa ist verliebt. Freshtorge (September 2022).